知識 バイオプロセス・バイオテクノロジー教育 細胞分画と遠心分離を支配する数学的および物理的原理とは何か?パイロットプラントでの分離の最適化
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技術チーム · LABPARK

更新しました 2ヶ月前

細胞分画と遠心分離を支配する数学的および物理的原理とは何か?パイロットプラントでの分離の最適化


細胞分画と遠心分離は、主に力の釣り合い、流体抵抗、粒子特性、および質量保存の法則によって支配されます。 細胞分画の過程では、機械的または超音波による破砕によって細胞内成分が放出され、その後、遠心分離によって無傷の細胞、核、細胞小器官、細胞破片、および可溶性物質がその沈降挙動に従って分離されます。重要な変数には、粒子の半径、粒子と流体の密度、培養液の粘度、遠心加速度、ローター形状、滞留時間、および供給濃度があります。

設計の中心的原理は、流体との密度差が大きい大きな粒子ほど速く沈降し、一方で粘度が高く滞留時間が短いほど分離が困難になるという点です。 したがって、パイロットプラントでの遠心分離では、ストークス型の沈降式と、ローター回転数、半径方向の位置、流量、温度、および全体的な物質収支を関連付ける必要があります。

細胞分画中に起こること

細胞破砕により粒子群が形成される

ホモジナイザーは、機械的せん断、圧力による破砕、または超音波キャビテーションを使用して細胞壁や細胞膜を破壊します。目的は、後続の分画に必要な細胞小器官の構造を維持しつつ、標的産物を放出させることです。

破砕された培養液は均一な懸濁液ではありません。そこには、未破砕の細胞、核、ミトコンドリア、膜断片、リボソーム、可溶性タンパク質、核酸、および微細な破片が含まれており、それぞれが異なる有効サイズ、形状、密度、沈降特性を持っています。

分離は物理的特性に依存する

遠心分離は、分子量のみで粒子を分離するわけではありません。細胞粒子の場合、サイズ、形状、密度、および流体抵抗が、各成分が液体中を移動する速度を共同で決定します。

一般的に、大型の真核細胞は、小型の細菌細胞や微細な破片よりも速く沈降します。しかし、不規則な形状、凝集、変形能、および水和の状態によって、理想的な固体球体とは異なる挙動を示すことがあります。

沈降を支配する力の釣り合い

遠心駆動の力

角速度(\omega)で回転するローター内の半径方向位置(r)にある粒子は、以下の遠心加速度を受けます:

[ a_c = \omega^2 r ]

遠心力は、置換された流体からの浮力によって相殺されます。したがって、正味の駆動力は密度差に比例します:

[ (\rho_p-\rho_f) ]

ここで(\rho_p)は粒子密度、(\rho_f)は流体密度です。

密度差は極めて重要です。培養液よりわずかに密度が高いだけの粒子には大きな遠心加速度が必要になる場合がありますが、より密度の高い粒子は低い相対遠心力で沈降させることができます。

粘性抵抗

ニュートン流体中をゆっくりと移動する球状粒子に対して、ストークスの抗力は以下の通りです:

[ F_D = 6\pi\mu R u_r ]

ここで、(\mu)は動粘度、(R)は粒子半径、(u_r)は半径方向の沈降速度です。

終末速度において、抗力は浮力補正された遠心力と釣り合います:

[ 6\pi\mu R u_r

\frac{4}{3}\pi R^3 \omega^2 r(\rho_p-\rho_f) ]

速度について解くと以下のようになります:

[ u_r

\frac{2R^2\omega^2r(\rho_p-\rho_f)}{9\mu} ]

これが理想的な分画遠心分離の中心的関係式です。

粒子半径が大きな影響を与える理由

沈降速度は(R^2)に比例します。したがって、密度差、粘度、および遠心場が一定であると仮定すると、粒子半径を2倍にすると理想的な沈降速度は4倍になります。

これが、低速での清澄化によって無傷の細胞や大きな破片を除去し、一方で小さな細胞小器官を後の高速ステップのために懸濁状態のままにできる理由です。

ローターの回転数と形状が分離に与える影響

相対遠心力(RCF)

ローターの回転数は、運用上、相対遠心力(RCF)として(g)単位で一般的に表現されます:

[ \mathrm{RCF}=\frac{\omega^2r}{g} ]

ここで(g)は標準重力加速度です。

RCFは半径方向の位置に依存するため、同じRPM(回転数)でもローターが異なれば異なるRCF値が生じます。パイロットプラントの設計において、RPMのみを指定することは不十分であり、ローター半径、および関連する最小、最大、または平均半径も考慮する必要があります。

ローター内での半径方向の移動

遠心加速度は半径とともに増加するため、粒子が外側に移動するにつれて粒子の速度も変化します。(u_r=dr/dt)を終末速度の式に代入すると、以下のようになります:

[ \frac{dr}{dt}

\frac{2R^2\omega^2r(\rho_p-\rho_f)}{9\mu} ]

半径(r_1)から(r_2)まで移動するのに必要な理想的な時間は以下の通りです:

[ t

\frac{9\mu}{2\omega^2R^2(\rho_p-\rho_f)} \ln\left(\frac{r_2}{r_1}\right) ]

この関係は、分離時間が角速度、粒子半径、密度差の増加とともに減少し、粘度の増加とともに増加することを示しています。

沈降速度と滞留時間

バッチ式遠心分離機では、粒子が運転時間内に回収領域に到達するかどうかが重要な問題となります。連続式遠心分離機では、その沈降時間が有効滞留時間よりも短いかどうかが対応する問題となります。

供給速度を上げると一般的に滞留時間が短くなり、回収率が低下する可能性があります。したがって、ローター回転数、清澄化面積、供給濃度、および流れの分布は、個別に最適化するのではなく、総合的に評価する必要があります。

パイロットプラントにおける分画遠心分離

段階的な力の選択

分画遠心分離では、一般的に遠心力を段階的に増加させます。低速運転で無傷の細胞や核をペレット化し、続いてより高い力で順次小さな細胞小器官や膜断片を分離します。

例示的な運転範囲には、無傷の細胞と核に対して約600 g、ミトコンドリアに対して15,000 g、ミクロソーム断片に対して100,000 gが含まれる場合があります。実際の分画は粒子の特性、ローター設計、培養液の組成、および必要な純度に依存するため、これらの値は普遍的な境界ではなく、プロセス固有の出発点です。

沈降係数

小さな粒子や高分子の場合、沈降は沈降係数を用いて記述されることが多いです:

[ s=\frac{u}{\omega^2r} ]

(s)の単位はスヴェドベリ(S)であり、(1\ \mathrm{S}=10^{-13})秒です。

沈降係数には、質量、浮力、および流体力学的摩擦が組み込まれています。これは細胞小器官、リボソーム、タンパク質、その他の粒子を比較するのに役立ちますが、形状や水和も沈降に影響するため、分子量のみとして解釈すべきではありません。

高分子の平衡

タンパク質やその他の高分子も、遠心場において半径方向の濃度勾配を形成することがあります。平衡状態では、濃度は半径方向の位置によって変化し、分子量、部分比容またはモル容積、溶媒密度、温度、および角速度に依存します。

濃度プロファイルは、角速度の2乗および半径方向の距離と指数関数的に関連しています。この平衡挙動は、実用的な目的が通常、定義されたプロセス時間内に懸濁粒子を回収ゾーンに移動させることである通常の清澄化とは異なります。

重要な流体およびプロセス変数

粘度と温度

培養液の粘度が高いと抗力が増加し、沈降が遅くなります。温度は粘度、密度、膜特性、および製品の安定性に影響を与える可能性があるため、温度管理は分離変数であると同時に製品品質の要件でもあります。

設計計算で使用される粘度は、可能な限り実際のプロセス流体を反映している必要があります。細胞破砕により、元の培養培地よりも培養液を大幅に粘性が高く、あるいは非ニュートン流体にするポリマー、核酸、タンパク質が放出される可能性があります。

密度差

駆動力は(\rho_p-\rho_f)に比例します。培養液の組成、緩衝液の濃度、溶解固形物、または温度の変化は流体密度を変化させ、その結果、分離性能を変化させる可能性があります。

粒子が流体密度に近い場合、遠心分離の効果は低下します。密度勾配法はこの特性を利用して高解像度の分画を行うことができますが、配合、充填、および回収に関する追加の考慮事項が必要になります。

粒子濃度と凝集

ストークスモデルは、実質的に無限の流体中を移動する孤立した粒子を想定しています。固形物濃度が高い場合、粒子同士が干渉し、沈降が阻害されます。

凝集は、見かけの粒子サイズを大きくし、沈降を改善する可能性がありますが、選択性を低下させたり、可溶性産物を捕捉したり、ペレットの再懸濁を困難にしたりする可能性もあります。したがって、パイロット試験では清澄化と製品回収率の両方を測定する必要があります。

遠心分離とパイロットプラントの物質収支の関連付け

回収率と収率

遠心分離機は、出口の清澄度だけで評価してはなりません。主な性能指標には、固形物除去、標的産物の回収率、濃縮倍率、ペレットの水分、および不純物の混入が含まれます。

標的成分について、基本的な回収率の計算は以下の通りです:

[ \text{回収率}

\frac{\text{目的の画分に回収された標的質量}} {\text{遠心分離機に入る標的質量}} \times 100% ]

これは、沈降理論と、細胞内または細胞外産物を回収するという実用的な目的を結びつけるものです。

全体および成分収支

パイロットプラントでは、供給液、清澄液、ペレット、洗浄流、およびリサイクルやホールドアップ量を追跡する必要があります。保存される成分について:

[ \dot m_{\text{供給}}

\dot m_{\text{液体}} + \dot m_{\text{ペレット}} + \dot m_{\text{損失}} ]

目的の産物が可溶性液体、細胞小器官画分、および廃棄される固形物の間に分配される可能性があるため、細胞破砕後の成分収支は特に重要です。

スケールアップの基準

パイロットスケールの遠心分離結果は、沈降速度、滞留時間、有効清澄化面積、固形物負荷、およびRCF分布などの物理的に意味のある基準を使用して変換する必要があります。

RPMのみは信頼できるスケールアップルールではありません。同じ速度で運転される2台の遠心分離機でも異なる加速度や流動挙動を生じる可能性があり、一方で速度が異なる2台の機械でも、有効な遠心場と滞留条件が適切に一致していれば同等の分離を提供できます。

トレードオフの理解

より高い力がより良い回収率を保証するわけではない

ローター回転数を上げると一般的に沈降速度は上がりますが、ペレットの圧密化、せん断の増加、壊れやすい細胞小器官の損傷、または不可逆的な凝集を促進する可能性もあります。

最適な運転ポイントは、必要な分離と回収を達成する最低の力と滞留時間です。過剰な力は清澄化を改善する一方で、目的の産物の価値を低下させる可能性があります。

理想的なストークス挙動には限界がある

ストークスの法則は、球状粒子、クリーピングフロー条件、一定の流体特性、および無視できる粒子間相互作用を前提としています。実際の生物学的懸濁液には、変形可能な細胞、不規則な断片、凝集物、非ニュートン流体、および広い粒子サイズ分布が含まれることがよくあります。

したがって、これらの式は最初の設計とスケーリングには不可欠ですが、実際の性能を決定するにはパイロット実験が必要です。

純度と回収率の競合

低速のステップは壊れやすい構造を維持するかもしれませんが、製品画分に不純物を残す可能性があります。高速のステップは小さな粒子の回収率を上げるかもしれませんが、同時に不要な破片やペレット内に捕捉された可溶性物質もペレット化してしまいます。

分画は、ペレットの外観のみに頼るのではなく、各画分の分析的特性評価を行い、必要な純度と回収率の目標に基づいて設計されるべきです。

熱およびせん断応力の重要性

遠心分離は熱を発生させる可能性があり、ポンプ、供給ゾーン、および高速機器はせん断力を加える可能性があります。これらの影響は、固形物の分離が成功しているように見えても、タンパク質の変性、細胞小器官の破壊、または製品活性の変化を引き起こす可能性があります。

パイロットプラントのプロトコルでは、RCFや運転時間に加えて、温度、圧力、供給速度、ホールドアップ時間、および製品品質を監視する必要があります。

目標に合わせた正しい選択

プロセスの目的に対する主要な物理的制約を一致させることで、運転条件を選択します。

  • 主な焦点が清澄化の場合: 粒子サイズ、密度差、粘度、流量、および滞留時間を使用して、細胞や大きな破片を除去するために必要な最小の遠心場を確立します。
  • 主な焦点が細胞小器官の分画の場合: 段階的な遠心力ステップを使用し、各画分を分析的に検証します。実際の細胞小器官の境界は普遍的なRCF値には存在しないためです。
  • 主な焦点が細胞内産物の回収の場合: 放出、溶解度、ペレットへの捕捉、および分解が回収率を共同で決定するため、破砕の強度と遠心分離を組み合わせて最適化します。
  • 主な焦点がパイロットから生産へのスケールアップの場合: RPMのみを合わせるのではなく、沈降能力、有効清澄化面積、固形物負荷、滞留時間、および製品品質を一致させます。
  • 主な焦点が高分子分離の場合: 分子の形状、水和、溶媒密度、および拡散を考慮しながら、沈降係数と平衡濃度プロファイルを使用します。

これらの原理を理解することで、エンジニアは遠心分離の設定を、分離、回収率、純度、およびスケールアップ性能に関する説得力のある予測へと変換できるようになります。

要約表:

原理または変数 分離への影響 パイロットプラントでの考慮事項
粒子半径 沈降速度は粒子半径の2乗で増加する 大きな細胞や破片はより低い力で除去可能
密度差 粒子と流体の密度差が大きいほど沈降が促進される 培養液の組成と温度が性能を変化させる可能性がある
粘度 粘度が高いほど抗力が増加し、沈降が遅くなる 特に破砕後の実際の培養液粘度を測定する
遠心力 RCFが高いほど半径方向の移動が促進される 壊れやすい製品を保護するために最も低い有効力を選択する
ローター形状 半径方向の位置が加速度と分離時間に影響する RPMだけでなくローター半径を指定する
滞留時間 滞留時間が長いほど粒子の除去が改善される 供給速度と回収率・処理量のバランスをとる
粒子濃度 固形物負荷が高いと沈降が阻害される 清澄化、ペレット形成、および製品の捕捉を評価する
物質収支 製品の回収率と不純物の分布を追跡する 供給、液体、ペレット、損失、およびリサイクル流を測定する
スケールアップ基準 沈降能力はRPM単体よりも意味がある 有効清澄化面積、固形物負荷、滞留条件を一致させる

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